2X 探針法qPCR Mix (TaqMan熒光定量PCR試劑盒)是基于熒光探針檢測的即用型 PCR 試劑盒,可以對靶片段進行實時定量 PCR 分析(quantitative PCR、qPCR)。
產品含有經過優(yōu)化的緩沖液組分、熱啟動 Taq DNA 聚合酶、Taq DNA 穩(wěn)定劑、dNTPs、MgCl2和穩(wěn)定劑等所有實時定量 PCR 所需要的成分
熒光定量PCR(qPCR)是大家常用的分子生物學技術,根據實驗方法的不同
qPCR可以分為染料法(SYBR Green法為代表)和探針法(Taqman法為代表)
因為操作簡單,價格便宜,SYBR Green法qPCR 受到了更為普遍的使用。
但是SYBR Green法并非萬能的,在很多時候SYBR Green無法滿足實驗的需要
Taqman qPCR特異性強,信噪比高,能夠適用于多重qPCR,數據更具說服力
Taqman法qPCR的原理:
Taqman是一段短的單鏈DNA探針,能夠和模板DNA進行退火。Taqman探針的5’端帶有一個報告基團(R),3’端帶有一個猝滅基團(Q)。報告基團所發(fā)出的熒光會被猝滅基團所吸收,因此正常情況下熒光探針是不會發(fā)出熒光的。在PCR的延伸過程中,DNA聚合酶沿著模板鏈從5’到3’的方向合成新鏈,當DNA聚合酶到達Taqman探針結合位點時,DNA聚合酶的5’-3’外切酶活性會將Taqman探針進行水解,導致Taqman探針的報告基團脫離了猝滅基團,從而發(fā)出熒光??梢愿鶕晒庵档母叩停袛郟CR過程中目的片段產生的多少,從而實現(xiàn)對目的基因進行實時定量。
在Taqman qPCR中,上下游引物只有擴增探針所結合的片段時,才會產生熒光,非特異擴增是不會產生熒光的,因此Taqman qPCR的特異性非常好。另外,可以用不同的報告基團,標記多個熒光探針,實現(xiàn)在一管PCR體系中,同時對多個基因進行定量,這樣不僅實驗的通量大大提高,而且實驗的一致性也更好。
什么時候需要使用探針法qPCR:
相對于SYBR Green qPCR,探針法qPCR需要設計和合成特異的熒光探針,增加了設計難度和實驗成本。但是,當你遇到如下情況時,Taqman qPCR是你的第一選擇。
>>>1.基因檢測
以Taqman為代表的探針法qPCR最常用的應用場景就是基因檢測,包括醫(yī)療診斷,環(huán)境微生物檢測,轉基因檢測等。這些應用場景對結果的特異性要求非常高,而染料法qPCR的結果很容易受到非特異性擴增的干擾,因此一般都是使用Taqman qPCR進行檢測。
>>>>2.很難設計特異性引物
qPCR對引物的擴增效率要求很高,如果用相對定量法(Livak法)進行數據分析,需要保證引物的擴增效率在90%到105%之間,否則最后得到的數據不真實。然而有時候,為了保證擴增的特異性,只能在某個特異位點設計引物,從而犧牲了一些其它的引物設計原則,比如GC含量過高,引物有二級結構等,導致qPCR擴增的效率過低。這種情況下用Taqman qPCR可以很好的解決這一點,因為Taqman 探針本身就可以保證特異性,因此設計引物的時候有更多靈活性,更容易設計擴增效率高的引物對。
>>>>3.發(fā)表高水平文章
由于Taqman法比SYBR Green法具有更好的特異性,實驗結果更接近真實,所以很多高水平文章更青睞于Taqman qPCR的結果。特別是一些關鍵基因的關鍵結果,如果有Taqman qPCR的數據,會給你的文章加分不少。
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