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①選取的RNA序列不對；
②樣品中沒有表達(dá)互作的蛋白質(zhì)。
③互作蛋白濃度低，銀染圖肉眼觀察不到差異條帶。
④其他
更多建議：
①lncRNA序列前期驗(yàn)證要完善；
②選擇相應(yīng)蛋白質(zhì)表達(dá)量較高的組織或細(xì)胞樣品；
③體外轉(zhuǎn)錄選擇轉(zhuǎn)錄質(zhì)量高的試劑盒，操作過程避免Rnase的污染；
④保證RNA Pull-down實(shí)驗(yàn)中探針標(biāo)記以及探針與蛋白的結(jié)合充分進(jìn)行（依據(jù)體外轉(zhuǎn)錄RNA的量，樣品裂解液蛋白濃度）；
⑤盡可能多將洗脫的蛋白電泳（同時(shí)可以避免顯色時(shí)間過長）
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