因為原核生物缺乏翻譯后的修飾，所以表達的真核蛋白和真核中表達有所差異，可能沒有生物學活性等，但是要是做免疫原應該沒問題；

基因需為cDNA，不能含有內(nèi)含子，原核細胞不能對mRNA進行剪切；

要分析DNA序列信息，分析其密碼子，由于原核與真核生物的密碼子偏好性不同，所以有時可能會出現(xiàn)稀有密碼子而影響表達的情況；

要注意你要表達蛋白的大小問題，一般情況下大于70KD的蛋白在原核菌種不容易表達或表大量低；

原核表達出來的一般是包涵體，所以蛋白的復性很關(guān)鍵，否則表達出來了也不能用，沒有活性。